Liste des Ateliers

• Atelier 1 – Stress thermique au microscope confocal (4 personnes)

  David Macherel (IMAC)

  Nous observerons l’impact direct des températures élevées sur des protoplastes et/ou plantules d’Arabidopsis avec différents marquages subcellulaires (mitochondrie, actine, ER…) sur un microscope confocal Nikon AX NSPARC.

  
  

  Atelier 2 – Mesures de densités stomatiques de plantes d’intérêt agronomique (4 personnes)

  Fabien MIART (MIAtecs) & Aurélia Rolland (IMAC)

  Comparaison de l’utilisation du système STOMmini (MIAtecs) et de l’Axiozoom Zeiss pour la mesure de densité stomatique. Utilisation d’outils d’IA pour l’analyse d’image. Les participants sont invités à apporter leur modèle pour tester le système. (Ne fonctionne pas avec Arabidopsis thaliana)

  
  

  Atelier 3 – Observations au microscope électronique à balayage (MEB) 

  Pierre Forestier (France Scientifique) & Fabienne Simonneau (IMAC)

  Nous réaliserons des observations de matériel végétal frais (ayant subi ou non un stress), et après congélation rapide, sur un MEB de table Pro G6 Phenom. Des analyses élémentaires (EDS) seront possibles. N’hésitez pas à nous contacter si vous souhaitez apporter des échantillons. 

  
  

  Atelier 4 – Démonstration Enderscope/ EnderNIRS  (6 personnes)

  Jérome Mutterer (IBMP Strasbourg) & Sirin Gharbi (IRHS-IMORPHEN)

  Cet atelier proposera une démonstration de l'Enderscope, une imprimante 3D détournée en système d'imagerie adapté pour les plantes. Les participants découvriront les principes de fonctionnement de cet outils open source et open hardware, ses performances en conditions expérimentales réelles, ainsi que des applications potentielles pour le suivi non invasif de caractéristiques biologiques (imagerie time lapse RGB, NIRS, fluorescence, ...). L’objectif est d’offrir une prise en main concrète et illustrée de cette technologie émergente et adaptative en imagerie végétale.

  
  

  Atelier 5 - Analyse d’image :  démonstration Intellisis et IA open source (8 personnes)

  Ingénieur application (Zeiss); Oumaima Karia & David Rousseau (IRHS-IMORPHEN)

  Capacité 8 personnes

  Des images acquises lors du workshop avec l’Axioscan (Zeiss) seront exploitées avec deux types de solutions faisant appel à l’IA: Intellisis et Ilastik.

  
  

  Atelier 6 – Visite de la plateforme PHENOTIC  - Installations robotisées de phénotypage  

  (6 personnes)

  Tristan Boureau (UMR IRHS-Emersys & PHENOTIC)

  Visite des installations de phénotypage à haut-débit de la plate-forme PHENOTIC https://phenotic.hub.inrae.fr/

Détails

Catégorie : workshop

Réunions du groupe de travail "Imagerie des Plantes" du GDR ImaBio (CNRS).

Historique

2025	ANGERS
2024	Strasbourg
2023	ENS Lyon et LyMIC/PLATIM 1 et 2 juin 2023
2022	Sophia Antipolis
2021	Versailles
2020
2019	Toulouse
2018	Strasbourg
2017	Gif-sur-Yvette
2016	Bordeaux
2015	Cadarache
2014	Montpellier
2013	Toulouse
2012	Strasbourg

L’étude des mécanismes d’adaptation des plantes au changement climatique constitue un enjeu majeur de la recherche en biologie végétale. L’exploitation des sondes et des rapporteurs fluorescents constitue un outil formidable pour des approches in vivo en biologie cellulaire et en microscopie. Cependant, étudier en direct l’impact des stress environnementaux sur du matériel végétal (plantes, tissus…) en microscopie reste difficile, notamment en ce qui concerne la température. Dans ce contexte, nous souhaitons que ces journées soient l’occasion d’échanges sur les approches développées sur ce thème dans divers laboratoires.

Le programme détaillé et l'emploi du temps prévu sont disponibles ci-dessous:

• Programme en français

Détails

Catégorie : workshop

Dates : Jeudi 19 et vendredi 20 mars 2026

Plan détaillé et accès